ふしぎの森の洞窟
中央部の洞窟
シナリオ序盤に入る洞窟。いたずらタヌキに惑わされた後、大妖精の泉から南西へ進むと入口が見えてくる。いたずらタヌキの道を通らなければ、細い道を東へ進むだけで入口に着く。いたずらタヌキの問題を解決するには、まずこの洞窟を通ってアイテムを入手する必要がある。
最初の部屋ではキースが4体もいる上、ひび割れた床が多いので注意しよう。紫の障害物を剣で破壊し、ひび割れた床を踏まないようにして、まずはキースをすべて倒そう。中央の宝箱は、その前にある岩を左か右へ動かせば、中身（50ルピー）を入手できる。
出口の部屋では、岩を押して道をあける必要がある。一例として上の画像の矢印の通りに岩を押せば出口へ進むことができる。洞窟を出たところでは『キノコ』を入手できるので、これを持って魔法おばばの家を目指そう。
なお、『ハートのかけら』が見えるが、最初の時点ではドクロを持ち上げることができないため、入手することができない。ツボのどうくつをクリアした後にまた訪れよう。
ツボのどうくつで『パワーブレスレット』を入手した後は、この部屋で『ハートのかけら9』を入手できる。南側から洞窟へ入り、上の画像の矢印の通りに岩を押し、2つのドクロを持ち上げよう。なお、ドクロの左側にある岩は押すことができない。
北部の洞窟
ふしぎの森には北部にも洞窟があるが、入口が岩に囲まれているため、入るには『パワーブレスレット』が必要。
また、洞窟内も特定のアイテムを入手していないと進めないようになっている。
洞窟内は大部分が空洞なので、慎重に行動しよう。右奥の宝箱（50ルピー）は2マス分の穴を跳び越えれば入手できる。『フックショット』を使った方が安全だが、『ロック鳥の羽根』でも跳び越えることも十分可能だ。
一方、左奥に見える『ハートのかけら24』は、『フックショット』がないと入手できない。ナマズの大口をクリアした後にこの洞窟へ入り、岩に『フックショット』を刺して渡ろう。岩は南側に押すことで落とすことができる。